O Centro de Inovação é uma associação entre a FGV EAESP e Organizações de sucesso no Brasil que buscam a compreensão e a prática da capacidade de inovar.
Sua criação, em maio de 2000, nasceu da ideia de desenvolver uma aliança entre empresas e universidade, de modo que ambos aprendessem e estudassem a questão da inovação, em um ambiente de colaboração.
Missão: Estimular e viabilizar a geração, sistematização, difusão e aplicação de conhecimentos sobre Organizações Inovadoras.
Visão: Ser o referencial brasileiro em conhecimentos sobre Organizações Inovadoras.
Valores:  Permanência (Continuidade e constância de propósitos); Relevância (Garantida pela associação com as organizações gestoras); Contribuição para a Sociedade (Finalidade primeira da FGV).
As atuais Organizações Gestoras são: FGV EAESP, Banco do Brasil, Brasilata, Embrapa, SEBRAE e Suzano.